Στο πλαίσιο ερευνητικών προγραμμάτων του ΙΜΣ με επιστημονικό υπεύθυνο τον Χρήστο Λούκο, έχει συγκεντρωθεί ένα πλούσιο υλικό από αρχεία, δημοσιευμένες πηγές, βιβλιογραφία, αποδελτιώσεις εφημερίδων κλπ. Αφορά ιδίως την Ερμούπολη αλλά και άλλες πόλεις και νησιά του ελληνικού κράτους κατά τον 19ο και 20ό αιώνα, τους πρόσφυγες από την Κρήτη κατά τον 19ο αιώνα, το Ρέθυμνο, τη Μικρά Ασία, την Αθήνα της Κατοχής κλπ, και εντάσσεται στις θεματικές της ιστορίας των πόλεων, της οικογένειας, της δημογραφίας, των επιδημιών και της δημόσιας υγείας. Μεγάλο μέρος της πληροφόρησης του αρχειακού υλικού έχει τροφοδοτηθεί σε βάσεις δεδομένων, στις οποίες πρόσβαση μπορεί να γίνει online από την ιστοσελίδα του ΙΜΣ-ΙΤΕ.